История происхождения коронавируса: от летучих мышей до человека

История происхождения коронавируса: от летучих мышей до человека

Ряд теорий о том, как мог появиться вирус, были отвергнуты. Большинство из оставшихся попадают под 3 возможных сценария:

• Вирус развился естественным путем, но сотрудник лаборатории заразился от образца и случайно «пронес» его в сообщество.
• Ученые лаборатории манипулировали образцами вируса и случайно или намеренно выпустили патоген.

Что делает происхождение вируса таким обсуждаемым, так это то, что различные его мутации и изучаемые фрагменты трудно объяснить. Хотя большинство вирусологов заявили, что коронавирус, вероятно, эволюционировал по своей природе, они согласились с тем, что разумно изучить возможность того, что он пришел из лаборатории. В основе этих подозрений лежит Уханьский институт вирусологии – исследовательский центр, основанный в 1950-х годах, который первым в Китае получил разрешение на высочайший уровень биобезопасности. Лаборатория института имеет уровень биобезопасности 4 (известный как BSL-4, самый высокий уровень). Это означает, что она оборудована для изучения самых опасных в мире инфекционных агентов и токсинов, которые требуют строжайших мер биологической сдержанности. Именно это обозначение и расположение лаборатории в городе, где впервые было сообщено о вспышке, сделали институт одним из первых подозреваемых.

Однако ученые говорят, что хотя утечка в лаборатории вероятна, это не обязательно означает, что это наиболее вероятное объяснение. Более вероятно, что вирус передался людям от животного, такого как летучая мышь. Опыт проведения полевых эпидемиологических исследований птичьего гриппа во Вьетнаме с 2008 по 2016 год показал, насколько тесный контакт с дикой природой, например, на «влажных рынках» по всему миру, где в уличных киосках продают мясо, морепродукты и живых животных для употребления в пищу, могут создавать легкие возможности для проникновения патогенов в человеческое население.

Происхождение от животных рассматривается как основная версия. Первый случай инфекции Covid-19 был прослежен до рынка морепродуктов Хуанань в Ухане, что привело к предположениям о том, что, возможно, это было место, где вирус перешел от животных к людям. Но с тех пор китайские исследователи обнаружили, что несколько из самых ранних известных случаев Covid-19 в городе не были связаны с рынком, а это означает, что вирус, возможно, уже распространялся в сообществе.

Совместное расследование Всемирной организации здравоохранения и Китая было сосредоточено на возможности зоонозного или животного происхождения. Отчет команды показал, что вирус, вероятно, появился у летучих мышей и перешел на промежуточное животное, прежде чем он распространился на людей.

Связанные вопросы и ответы:

Какой вирус является прародителем коронавируса COVID-19

Согласно филогенетическому анализу, SARS-CoV-2 попал в человеческую популяцию в конце ноября — начале декабря 2019 года,. Судя по всему, это было единичное случайное событие. SARS-CoV-2 вызывает COVID-19. SARS-коронавирусы чаще всего циркулируют в летучих мышах, которые являются естественными резервуарами этих патогенов. Пандемический потенциал других SARS-коронавирусов неясен, но вызывает серьезные опасения.

Филогенетически ближайший к SARS-CoV-2 коронавирус RaTG13 обнаружили у летучей мыши в китайской провинции Юннань. Число идентичных нуклеотидов между геномами этих двух вирусов составляет приблизительно 96%. Четыре процента различий — это довольно много. Последний общий предок SARS-CoV-2 и RaTG13 существовал десятки лет назад: за один год в геноме возникает примерно 0,08% мутаций. Некоторые участки поверхностного белка SARS-CoV-2 больше похожи на соответствующие регионы коронавируса, выделенного из панголинов. Это говорит лишь о том, что сейчас не известны практически идентичные SARS-CoV-2 последовательности геномов вирусов, выделенных не из человека. Значит, промежуточный хозяин SARS-CoV-2, от которого заразился нулевой пациент , пока неизвестен. Отметим, что геномы коронавирусов, выделенных из цивет и верблюдов, практически идентичны геномам SARS-CoV и MERS-CoV соответственно. В результате промежуточный хозяин двух предыдущих человеческих коронавирусов был быстро определен. Есть надежда, что секвенирование вирома животных того региона, где началась пандемия, покажет промежуточного хозяина SARS-CoV-2.

Какой вид животных является носителем коронавируса, передавшегося на человека

Промежуточными переносчиками коронавируса, вспышка которого началась в Китае, могут быть панголины. В Азии эти млекопитающие с чешуйчатой броней считаются деликатеосом, сообщила "Фонтанка.ру".

Вирус, болезнь.

visualhunt.com

Исследование провела группа учёных, возглавляемая сотрудниками Южно-Китайского сельскохозяйственного университета.

Молекулярно-биологический анализ генома панголинов в 70% случаев дал положительный результат на бетакоронавирус.

При дальнейшем выделении вируса исследователи смогли более детально рассмотреть его структуру. После этого специалисты обнаружили, что штамм коронавируса в организме животных на 99% совпадает с тем, что был обнаружен ранее у людей, сообщил ТАСС.

Панголин

fishki.net

Ранее говорилось, что главными переносчиками коронавируса, который к концу первой недели февраля убил больше 560 человек, стали летучие мыши. По цепочке он перешёл к другим животным, а уже от них – к человеку. При этом наиболее вероятными временными хозяевами могут быть не только панголины. Исследователи продолжают изучать образцы генетического материала.

Что известно о панголинах

Название отряда «панголины» произошло от малайского слова pengguling, что переводится как «сворачивающийся в шар». Четыре вида этих млекопитающих обитают в Юго-Восточной Азии, ещё столько же в Африке.

Животные близки к броненосцам и муравьедам. Их чешую принято использовать в народной медицине.

Местные СМИ сравнивают стоимость этой чешуи на черном рынке со стоимостью серебра. Мясо панголинов считается деликатесом в Китае и Вьетнаме.

Какие места и сферы деятельности связывают с первым возникновением коронавируса

3 марта 2020 года из Испании пришла новость, которой многие не придали большого значения. Сообщалось, что в стране признана первая смерть от коронавируса,ретроспективного исследования.Власти Валенсиичто еще 13 февраля от тяжелой пневмонии неизвестного происхождения умер мужчина 69 лет, вернувшийся из путешествия в Непал. Повторное вскрытие, проведенное после изменения Минздравом критериев поиска зараженных 27 февраля, дало положительный анализ на COVID-19. К этому моменту в регионе Валенсия числились 19 больных. На 27 марта их было уже 3,2 тыс., 167 умерли.

В Италии, где так и не удалось определенно установить, от кого же заразился самый первый непривозной пациент, 38-летний Маттиа из Кодоньо, самые разные данные указывают на более раннюю циркуляцию вируса. Вирусологи из Университета Милана и миланского госпиталя Сакко утверждают, что картирование генома указывает на присутствие СOVID-2019 в Италии. С этим согласуются данные медицинской статистики: нетипичные вспышки тяжелой пневмонии врачи. Наконец, свежее детальное исследование лабораторных образцов в сочетании с опросом пациентов надежно устанавливает, что, в день постановки диагноза первому больному, вирус циркулировал в Южной Ломбардии. Происхождение болезни самого Маттиа изучали с помощью филогенетического исследования вирусного генома. Дело в том, что вирус постоянно мутирует и, изучая геном вирусов, взятых у разных больных в разных странах, можно проследить его эволюцию примерно так, как лингвисты изучают эволюцию языков. Судя по всему, инфицировавший Маттиа вирусс первой локальной вспышкой этой инфекции в Европе, которая произошла 19 января в Мюнхене, однако цепочку заражения от человека к человеку установить не удалось.

Какие факторы способствовали распространению коронавируса изначально

Ещё в мае 2020 года учёные из Вашингтонского университета изучили особенности распространения CoViD-19 в России. Тогда учёные предположили, что "корону" в Россию завезли не из Китая, который до сих пор считается отправной точкой глобальной пандемии, а из стран Европы. География распространения CoViD-19 пока не позволяет сказать, как именно и в какой точке земного шара началась пандемия, однако для общего понимания ситуации эти данные крайне важны.

Существующая схема развития пандемии, которая до сих пор хранится на сайте ООН , подтверждается каждый раз, когда миру угрожает серьёзная инфекция. Однако шесть этапов, переход через которые может стать причиной для объявления пандемии, в случае с CoViD-19 могли быть пройдены существенно раньше. Отличие коронавируса от эпидемий птичьего и свиного гриппа состоит в том, что нулевой пациент ошибочно выявлялся в нескольких регионах мира. Изначально нулевым пациентом считался сотрудник секретной лаборатории института вирусологии в городе Ухань, затем посетитель рыбного рынка в том же городе.

Однако через два месяца после начала пандемии сотрудники университетской больницы в Париже обнаружили частицы вируса SARS-CoV-2 в замороженном образце мокроты, пробы которой были взяты ещё в декабре 2019 года. С учётом того, что симптоматика и клинические проявления коронавируса на тот момент были изучены слабо, учёные предположили, что нулевой пациент мог заразиться инфекцией ещё в ноябре, то есть до официального начала пандемии в КНР. Получается, китайцы стали жертвой пандемии точно так же, как и весь мир?

Какие страны были первыми, которые столкнулись с вспышкой COVID-19

Иллюстративное фото: pexels.com

Сегодня, 17 ноября, исполняется ровно год с того момента, как был подтвержден первый случай COVID-19. Первый заболевший был выявлен не в декабре, как считалось раньше, а в ноябре, пишет South China Morning Post .

Первый подтвержденный случай заболевания COVID-19 в Китае датируется 17 ноября. Согласно правительственным данным, первым человеком, инфицированным новой болезнью, был житель провинции Хубэй в возрасте 55 лет, но "нулевой пациент" еще не подтвержден.

Интервью с информаторами из медицинского сообщества показывают, что китайские врачи осознали, что имеют дело с новой болезнью только в конце декабря.

С этой даты каждый день регистрировалось от одного до пяти новых случаев. К 15 декабря общее количество инфекций составило 27 - первый двузначный ежедневный рост был зарегистрирован 17 декабря - а к 20 декабря общее количество подтвержденных случаев достигло 60.

Сегодня, спустя год, коронавирус нового типа успел проявиться в 55 021 938 случаях. Погибли от нового вируса 1 327 228 человек.

Прошел ровно год, а коронавирус успел оставить отрицательный след практически во всех сферах жизнедеятельности людей.

Первый, кто почувствовал на себе силу COVID-19, стал Китай. Ухань, откуда и пошла пандемия, был закрыт на карантин, людям запрещалось выходить из домов, а на улицах в люди спецодежде распыляли обеззараживающие средства.

Тогда весь мир наблюдал за действиями Китая, не осознавая, что все это придет почти в каждую страну мира. Уже 11 марта ВОЗ объявила, что вспышка COVID-19 может быть охарактеризована как пандемия.

Тогда же Европа стала новым эпицентром коронавируса SARS-CoV-2. Весной особенно пострадала Италия, где регистрировались рекордные числа по заражению и смертности. В Италии ввели карантин, учеба и работа перешли на удаленную форму, развлекательные центры закрылись, были доступны только магазины продуктов и аптеки.

С весны во многих странах были введены ограничения, в том числе и в Казахстане. С тех пор люди поменяли свой образ жизни: стали носить маски в общественных местах, в магазинах продавцы надевают резиновые перчатки, жители страны реже ходить в развлекательные заведения и рестораны. Во время карантина стали популярны онлайн-тренинги, домашние тренировки заменили спортзал.

Коронавирус нового типа очень сильно ударил по экономикам стран всего мира. Всемирный банк предрекал нищету 40 млн жителям азиатских стран.

Ближе к лету новым очагом распространения стали США. До сегодняшнего дня Соединенные Штаты продолжают лидировать по числу зараженных КВИ в мире.

В летнее время некоторые страны позволили открыть свои границы для путешественников, чтобы начать восстанавливать свою экономику.

С наступлением осени в Европе вновь началась волна COVID-19. Франция, Испания и Великобритания стали новыми очагами вируса. Европейские страны ввели жесткие ограничения, которые вызвали обвал фондового рынка.

Целый год ученые всего мира пытаются разработать вакцину против COVID-19. На сегодняшний день известно о высокой эффективности трех вакцин: Pfizer, Спутник V и Moderna.

Тем не менее, вакцина не сможет полностью убить вирус, но сможет помочь его сдерживать.

Ранее мы писали о кризисе COVID-19 в России.

Какие меры предосторожности должны были быть приняты, чтобы предотвратить появление коронавируса

Александр Панчин, старший научный сотрудник Института проблем передачи информации имени Харкевича РАН, биоинформатик:

«Никаких публикаций, которые бы содержали упомянутые Саксом многочисленные свидетельства, нет. Все аргументы в пользу гипотезы лабораторной утечки были озвучены. И на каждый из этих аргументов в научном сообществе были даны серьезные возражения. Например, главный аргумент — наличие фуринового сайта в последовательности, который возник с нуля, а ученые ранее проводили эксперименты по внедрению таких фуриновых сайтов.

Александр Панчин, старший научный сотрудник Института проблем передачи информации имени Харкевича РАН, биоинформатик
Денис Каминев для RTVI

У ближайшего родственника SARS-CoV-2 — коронавируса летучих мышей — этого сайта нет, а он важен, потому что в этом месте происходит модификация белка, из-за чего этот белок приходит в свою активную конформацию и это способствует более эффективному заражению. Но есть множество примеров того, как независимо возникали новые сайты у огромного количества разных коронавирусов. То есть это событие, которое не требует вмешательства человека, это нормальное эволюционное явление.

Более того, те фуриновые сайты, которые являются каноническими и которые использовали ученые в работах, где была генная инженерия вирусов, отличались от того, что есть у коронавируса SARS-CoV-2.

Самый главный аргумент конспирологов в том, что в Ухани есть лаборатория, которая занималась вирусами, и все началось в Ухани. Но вообще эпидемиям свойственно начинаться в крупных городах. В любом более-менее крупном городе в Китае можно найти какую-нибудь лабораторию.

При этом в Ухани есть рынок, и на этом рынке были обнаружены ранние следы вируса. Не факт, что он там впервые человеку перескочил, конечно, но это очень сильный аргумент в пользу того, что изначально он передавался людям от животных. Мы знаем также, что вирус обладает таким интересным свойством, что он очень легко передается от человека к другим видам — норкам, собакам, кошкам. То есть так ведут себя вирусы, которые обладают высоким потенциалом к зоонозу — перескакиванию с одного вида на другой. А раз вирус спокойно передается от одного животного к другому, то он легко мог передаться и от животного к человеку.

Еще одно подозрение пало на Ухань, потому что был момент, когда самый близкий к коронавирусу SARS-CoV-2 вирус летучих мышей был обнаружен в уханьской лаборатории. Но уже тогда было понятно, что это все равно очень далекий от SARS-CoV-2 вирус, и что один из другого не получить в разумные сроки каким либо образом.

Да, такую вставку сделать можно и любую другую вставку воспроизвести в лаборатории. Но речь не об этом. Речь о том, что существует совершенно нормальное естественное объяснение и в пользу гипотезы утечки требуются какие- то весомые аргументы.

Как можно подтвердить утечку? Например, если бы у сотрудников уханьской лаборатории на момент начала эпидемии были антитела, но антител у них не было. Да, в Китае, вероятно, соврали, но в этом и проблема теорий заговора — что они в принципе неопровержимы.

Допустим, завтра мы найдем предка SARS-CoV-2 с 99,9999%-ым сходством с ожидаемым предком. Найдем его у какой-нибудь летучей мыши, в какой-нибудь провинции, из которой поступали животные на рынок Ухани. Казалось бы, это должно поставить точку в вопросе? Нет, ведь что скажут конспирологи? Что китайцы специально сделали такой вирус постфактум и заразили им летучих мышей в этой провинции, чтобы доказать, что они не причастны.

То есть, какой бы аргумент не привели сторонники природного происхождения вируса, какой бы довод не привели, конспирологов это не успокоит, как конспирологов не переубедить в том, что американцы не были на Луне.

Опровергнуть конспирологическую теорию невозможно, и именно это делает ее антинаучной, поскольку эти теории не фальсифицируемы. Действительно, в лаборатории можно сделать совершенно любой вирус. Но из того, что современные биотехнологии позволяют создать ВИЧ, не следует, что ВИЧ сделан в лаборатории.

Была конспирологическая теория, что ВИЧ Рейган создал для того, чтобы бороться с геями. Сегодня мы знаем, что это не так, но все равно есть люди, которые в это верят. История повторяется: когда открыли вирус иммунодефицита человека, то точно такие же аргументы звучали, что вирус получен гибридизацией некоторых известных вирусов,в военной лаборатории. Когда его анализировали, тоже начали говорить — смотрите, тут есть следы генной инженерии, хотя их там нет. И даже когда подробно было установлено происхождение ВИЧ из Африки, все равно до сих пор есть куча людей, которые считают, что он был создан искусственно. Это к вопросу о том, можно ли поставить точку в этом споре. В науке точка поставлена. Никто не пишет статей с призывами рассмотреть искусственное происхождение ВИЧ».

Возможно ли, что коронавирус был создан искусственно в лаборатории

Ученые из Сколковского института науки и технологий, Института проблем передачи информации имени Харкевича при Российской академии наук, Первого государственного медицинского университета имени Павлова и НИИ гриппа имени Смородинцева опубликовали препринт работы на портале Virological.org , в которой рассказали о 47-летней пациентке с Covid-19. Дело в том, что в ее случае коронавирус приобрел 18 мутаций, а болела она более четырех месяцев.

В конце марта прошлого года женщину с В-клеточной неходжкинской лимфомой четвертой стадии госпитализировали для прохождения плановой химиотерапии ритуксимабом (противоопухолевое средство из группы моноклональных антител). Она лежала в одной палате с пожилой пациенткой, у которой вскоре выявили Covid-19.

17 апреля 47-летнюю женщину выписали из больницы, однако менее чем через две недели у нее диагностировали коронавирусное заболевание. «К тому времени у нее появились симптомы Covid-19 (повышенная температура тела). Этот исходный образец был отброшен сразу после тестирования и не был доступен для секвенирования. Повторные мазки из носоглотки от 14 мая, 19 мая, 9 июня и 14 июля дали отрицательный результат на SARS-CoV-2. Тем не менее у пациентки с 25 мая по 21 августа наблюдались симптомы тяжелой формы Covid-19. Результаты ее тестирования вновь оказались положительными 3, 5, 8, 11, 13, 17, 20, 21, 26, 27 августа, а также 3 и 9 сентября. Наконец, результат был отрицательным 12 сентября, а затем повторно 10 ноября и 16 декабря», — пишут авторы исследования.